احتلت جامعة أسيوط، المركز الخامس ضمن أفضل خمس جامعات مصرية لعام،2016 وذلك وفق ما أعلنه موقع U.S.NEWS التعليمي في تصنيفه الجامعات على مستوى العالم، وقد حققت جامعة أسيوط إجمالي نقاط يبلغ 53 نقطة والتى احتلت به المركز الخامس بعد جامعات القاهرة، وعين شمس والإسكندرية ثم جامعة المنصورة في المركز الرابع.
كما احتلت جامعة أسيوط المرتبة العشرون على مستوى أفضل الجامعات العربية، والذي ضم تصنيف نحو 124 جامعة على مستوى شتى الدول العربية، وقد أعتمد التصنيف على عدد من المعايير تشمل المكانة الأكاديمية للجامعة بين الأوساط الجامعية وكذلك فى سوق العمل، كما تضمن عدد ألاستشهادات بأبحاث الجامعة وإجمالي مطبوعاتها.